Новый Васюган основан «по воле партии» во время коллективизации ссыльными крестьянами Омской, Новосибирской областей и Алтайского края и первоначально назывался Могильный яр. В сороковые годы прошлого века население пополнялось ссыльными с Прибалтики, Кавказа.

Память сохранила с тех времён имена хороших врачей и прекрасную художественную самодеятельность. Вероятно, это объясняется стремлением выжить в нечеловеческих условиях и сохранить при этом душу. Нововасюганцы помнят Дмитрия Николаевича Лаврова, Нели Михайловну Якупову, Мильду Яновну Вейс, Виктора Васильевича Тэна, Лидию Фёдоровну Кузьмину, Леонида Куприяновича Ветова. Но память сохранила и первого коменданта Смирнова и избушку Власова, который с дочерью встречал бежавших через Васюганское болото ссыльных крестьян, давал им переночевать, а потом убивал по дороге, чтобы ограбить. В память о тех тяжёлых временах в Новом Васюгане установлен первый в Томской области памятник репрессированным.

До 1959 г. Новый Васюган был административным центром Васюганского района. После снятия комендатуры расположенные по реке Васюган «ссыльные деревни» начали стремительно исчезать, и Васюганский район был ликвидирован. Но Новый Васюган не исчез; геологи вдохнули в него новую жизнь. Заслуженно остались в истории Нового Васгогана геологи Нина Михайловна Павленко, Валентин Николаевич Лычёв, Георгий Семёнович Жуков, Рафаил Хасанович Багаутдинов, Николай Иванович Верещака, Федюшкин, Василий Пантелеевич Сучков, Михаил Иванович Плахтырь.

Пионерный, Игол, Крапива, Двуречка — названия вахтовых посёлков и месторождений, известные многим жителям Томской области, да и не только Томской.   На них работают и многие нововасюганцы.

Как и в тридцатые годы прошлого века, нововасюганцы занимаются охотой, рыбалкой, сбором грибов, ягод, кедрового ореха, лекарственных трав, заготовкой и переработкой древесины. Но возможности многократно уменьшились в связи с интенсивной добычей нефти, сокращением площади угодий, неизбежным экологическим вредом и причиняемым беспокойством животному миру.